Analyse du gène du Cytochrome B d'équidés anciens méditerranéens : limites et perspectives
Résumé
La détermination de l'espèce à laquelle appartient le matériel génétique repose sur l'amplification d'un fragment de la région codante de l'ADN mitochondrial, le gène du Cytochrome b. Ce gène, très conservé au cours de l'évolution, porte une séquence spécifique de chaque espèce. C'est pourquoi, il est possible d'amplifier cette séquence à l'aide d'une paire d'amorces universelles pour une grande variété d'espèces, dont l'espèce humaine. Nous avons étudié la possibilité de séquençage de ce gène pour neuf ossements d'équidés appartenant pour sept d'entre eux au site d'Amphipolis en Grèce (Malama, Gardeisen 2005) et pour les deux autres (fœtus équidés) au site de Els Vilars en Catalogne (Nieto et al. dans ce volume ). L'ADN a été extrait à partir de poudres d'os anciens obtenues après fraisage de ceux-ci. Sur les sept ossements du site d'Amphipolis, nous n'avons pu mettre en évidence aucune séquence, soit en raison de l'extrême dégradation de l'ADN (fragmentation très importante de l'ADN), soit en raison de la présence d'inhibiteurs de la PCR. Sur les deux ossements de fœtus du site de Vilars, nous avons été confrontés à une contamination par de l'ADN exogène humain. Cette contamination a fait l'objet d'une identification de profil mitochondrial afin d'en déterminer l'origine.