Etude de la diversité génétique du maïs en Europe : analyse d'ADN ancien à partir d'échantillons d'herbier et confrontation avec l'analyse moléculaire à grande échelle de collections de populations
Résumé
European maize was introduced from Central America in the South of Europe at the end of the 15th century, and from Northern America in the North of Europe following the expeditions of the early 16th century. In order to better understand its later history in Europe, we compared the genetic diversity of European maize in the 19th century and the first half of the 20th century, represented by plants collected in an ancient herbarium, with the diversity of American and European maize populations collected around 50 years ago and maintained as living samples in collections. Samples were obtained from the herbarium of Paris (MNHN). Fractions of leaves or spikelets (from 2 to 37 mg) were collected from 17 plates. Samples are 138 years old in average (from the second half of the 18th century to 1949). They originated from all over France, with half in the Paris basin. DNA was successfully extracted from leave or spikelet fragments, using the Kit Qiagen® method. Precautions were taken to avoid contamination with foreign DNA. A total of 80 μl of DNA was obtained per sample. DNA samples were analysed with 14 nuclear mocrosatellite markers, ten of them displaying a tetra nucleotidic motive. From 4 to 14 markers could be analysed per sample.
L'objectif de l'étude est d'analyser la diversité des maïs en Europe en confrontant la diversité analysée à partir d'herbiers anciens avec celle trouvée dans une étude réalisée sur 273 populations de maïs d'origine américaine et européenne, conservées en semences et renouvelées régulièrement depuis cinquante ans environ. L'étude a porté sur 17 planches de l'Herbier du Muséum d'Histoire Naturelle de Paris datant de 138 ans en moyenne, prélevées en France et majoritairement dans le Bassin parisien. A partir de fragments de feuilles ou d'épillets, l'ADN a été extrait par la méthode du Kit Qiagen et analysé avec succès pour 4 à 14 marqueurs microsatellites nucléaires. Analysée à l'aide d'une matrice de distance de Roger, la variabilité génétique se structure en trois groupes où sont majoritaires respectivement : les populations nord américaines anciennes (Northern Flint), les autres populations américaines, les populations européennes. Les plantes d'herbier se positionnent essentiellement dans le groupe des populations européennes. Ce résultat est confirmé par l'identification des populations les plus proches de chaque planche d'herbier. L'hybridation entre les Northern Flint et les populations Caraïbes et du sud de l'Espagne, qui est supposée avoir donné naissance à la diversité européenne, apparaît donc antérieure à la collecte des plantes d'herbier.
Origine : Accord explicite pour ce dépôt
Loading...